Christian Marzahl

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Years Active: 2012-2024
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Bildverarbeitung für die Medizin

Medical Image Anal.

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Philippe Weitz, Masi Valkonen, Leslie Solorzano, Circe Carr, Kimmo Kartasalo, Constance Boissin, Sonja Koivukoski, Aino Kuusela, Dusan Rasic, Yanbo Feng, Sandra Kristiane Sinius Pouplier, Abhinav Sharma, Kajsa Ledesma Eriksson, Stephanie Robertson, Christian Marzahl, Chandler D. Gatenbee, Alexander R. A. Anderson, Marek Wodzinski, Artur Jurgas, Niccolò Marini, Manfredo Atzori, Henning Müller, Daniel Budelmann, Nick Weiss, Stefan Heldmann, Johannes Lotz, Jelmer M. Wolterink, Bruno De Santi, Abhijeet Patil, Amit Sethi, Satoshi Kondo, Satoshi Kasai, Kousuke Hirasawa, Mahtab Farrokh, Neeraj Kumar, Russell Greiner, Leena Latonen, Anne-Vibeke Laenkholm, Johan Hartman, Pekka Ruusuvuori, Mattias Rantalainen
The ACROBAT 2022 challenge: Automatic registration of breast cancer tissue. Medical Image Anal. 97 (2024)
Jonathan Ganz, Christian Marzahl, Jonas Ammeling, Barbara Richter, Chloé Puget, Daniela Denk, Elena A. Demeter, Flaviu A. Tabaran, Gabriel Wasinger, Karoline Lipnik, Marco Tecilla, Matthew J. Valentine, Michael J. Dark, Niklas Abele, Pompei Bolfa, Ramona Erber, Robert Klopfleisch, Sophie Merz, Taryn A. Donovan, Samir Jabari, Christof A. Bertram, Katharina Breininger, Marc Aubreville
On the Value of PHH3 for Mitotic Figure Detection on H&E-stained Images. CoRR (2024)
Christof A. Bertram, Christian Marzahl, Alexander Bartel, Jason Stayt, Federico Bonsembiante, Janet Beeler-Marfisi, Ann K. Barton, Ginevra Brocca, Maria E. Gelain, Agnes C. Gläsel, Kelly du Preez, Kristina Weiler, Christiane Weissenbacher-Lang, Katharina Breininger, Marc Aubreville, Andreas K. Maier, Robert Klopfleisch, Jenny Hill
Abstract: Cytologic Scoring of Equine Exercise-induced Pulmonary Hemorrhage - Performance of Human Experts and a Deep Learning. Bildverarbeitung für die Medizin (2024)
Frauke Wilm, Marco Fragoso, Christian Marzahl, Jingna Qiu, Chloé Puget, Laura Diehl, Christof A. Bertram, Robert Klopfleisch, Andreas K. Maier, Katharina Breininger, Marc Aubreville
Abstract: Pan-tumor CAnine CuTaneous Cancer Histology (CATCH) Dataset. Bildverarbeitung für die Medizin (2023)
Marc Aubreville, Nikolas Stathonikos, Christof A. Bertram, Robert Klopfleisch, Natalie ter Hoeve, Francesco Ciompi, Frauke Wilm, Christian Marzahl, Taryn A. Donovan, Andreas K. Maier, Mitko Veta, Katharina Breininger
Abstract: the MIDOG Challenge 2021 - Mitosis Domain Generalization in Histopathology Images. Bildverarbeitung für die Medizin (2023)
Marc Aubreville, Nikolas Stathonikos, Christof A. Bertram, Robert Klopfleisch, Natalie ter Hoeve, Francesco Ciompi, Frauke Wilm, Christian Marzahl, Taryn A. Donovan, Andreas K. Maier, Jack Breen, Nishant Ravikumar, Youjin Chung, Jinah Park, Ramin Nateghi, Fattaneh Pourakpour, Rutger H. J. Fick, Saima Ben Hadj, Mostafa Jahanifar, Adam Shephard, Jakob Dexl, Thomas Wittenberg, Satoshi Kondo, Maxime W. Lafarge, Viktor H. Koelzer, Jingtang Liang, Yubo Wang, Xi Long, Jingxin Liu, Salar Razavi, April Khademi, Sen Yang, Xiyue Wang, Ramona Erber, Andrea Klang, Karoline Lipnik, Pompei Bolfa, Michael J. Dark, Gabriel Wasinger, Mitko Veta, Katharina Breininger
Mitosis domain generalization in histopathology images - The MIDOG challenge. Medical Image Anal. 84 (2023)
Philippe Weitz, Masi Valkonen, Leslie Solorzano, Circe Carr, Kimmo Kartasalo, Constance Boissin, Sonja Koivukoski, Aino Kuusela, Dusan Rasic, Yanbo Feng, Sandra Kristiane Sinius Pouplier, Abhinav Sharma, Kajsa Ledesma Eriksson, Stephanie Robertson, Christian Marzahl, Chandler D. Gatenbee, Alexander R. A. Anderson, Marek Wodzinski, Artur Jurgas, Niccolò Marini, Manfredo Atzori, Henning Müller, Daniel Budelmann, Nick Weiss, Stefan Heldmann, Johannes Lotz, Jelmer M. Wolterink, Bruno De Santi, Abhijeet Patil, Amit Sethi, Satoshi Kondo, Satoshi Kasai, Kousuke Hirasawa, Mahtab Farrokh, Neeraj Kumar, Russell Greiner, Leena Latonen, Anne-Vibeke Laenkholm, Johan Hartman, Pekka Ruusuvuori, Mattias Rantalainen
The ACROBAT 2022 Challenge: Automatic Registration Of Breast Cancer Tissue. CoRR (2023)
Frauke Wilm, Marco Fragoso, Christian Marzahl, Jingna Qiu, Christof A. Bertram, Robert Klopfleisch, Andreas K. Maier, Katharina Breininger, Marc Aubreville
Pan-Tumor CAnine cuTaneous Cancer Histology (CATCH) Dataset. CoRR (2022)
Mathias Öttl, Jana Mönius, Christian Marzahl, Matthias Rübner, Carol I. Geppert, Arndt Hartmann, Matthias W. Beckmann, Peter A. Fasching, Andreas K. Maier, Ramona Erber, Katharina Breininger
Superpixel Pre-Segmentation of HER2 Slides for Efficient Annotation. CoRR (2022)
Mathias Öttl, Jana Mönius, Christian Marzahl, Matthias Rübner, Carol I. Geppert, Arndt Hartmann, Matthias W. Beckmann, Peter A. Fasching, Andreas K. Maier, Ramona Erber, Katharina Breininger
Superpixel Pre-segmentation of HER2 Slides for Efficient Annotation. Bildverarbeitung für die Medizin (2022)
Marc Aubreville, Nikolas Stathonikos, Christof A. Bertram, Robert Klopfleisch, Natalie D. ter Hoeve, Francesco Ciompi, Frauke Wilm, Christian Marzahl, Taryn A. Donovan, Andreas K. Maier, Jack Breen, Nishant Ravikumar, Youjin Chung, Jinah Park, Ramin Nateghi, Fattaneh Pourakpour, Rutger H. J. Fick, Saima Ben Hadj, Mostafa Jahanifar, Nasir M. Rajpoot, Jakob Dexl, Thomas Wittenberg, Satoshi Kondo, Maxime W. Lafarge, Viktor H. Koelzer, Jingtang Liang, Yubo Wang, Xi Long, Jingxin Liu, Salar Razavi, April Khademi, Sen Yang, Xiyue Wang, Mitko Veta, Katharina Breininger
Mitosis domain generalization in histopathology images - The MIDOG challenge. CoRR (2022)
Sonja Kunzmann, Christian Marzahl, Felix Denzinger, Christof Bertram, Robert Klopfleisch, Katharina Breininger, Vincent Christlein, Andreas K. Maier
First Steps on Gamification of Lung Fluid Cells Annotations in the Flower Domain. Bildverarbeitung für die Medizin (2022)
Luisa Theelke, Frauke Wilm, Christian Marzahl, Christof A. Bertram, Robert Klopfleisch, Andreas Maier, Marc Aubreville, Katharina Breininger
Iterative Cross-Scanner Registration for Whole Slide Images. ICCVW (2021)
Marc Aubreville, Christof A. Bertram, Christian Marzahl, Corinne Gurtner, Martina Dettwiler, Anja Schmidt, Florian Bartenschlager, Sophie Merz, Marco Fragoso, Olivia Kershaw, Robert Klopfleisch, Andreas Maier
Abstract: Deep Learning Algorithms Out-perform Veterinary Pathologists in Detecting the Mitotically Most Active Tumor Region. Bildverarbeitung für die Medizin (2021)
Christian Marzahl, Jenny Hill, Jason Stayt, Dorothee Bienzle, Lutz Welker, Frauke Wilm, Jörn Voigt, Marc Aubreville, Andreas K. Maier, Robert Klopfleisch, Katharina Breininger, Christof A. Bertram
Inter-Species Cell Detection: Datasets on pulmonary hemosiderophages in equine, human and feline specimens. CoRR (2021)
Frauke Wilm, Christian Marzahl, Katharina Breininger, Marc Aubreville
Domain Adversarial RetinaNet as a Reference Algorithm for the MItosis DOmain Generalization Challenge. MIDOG/MOOD/Learn2Reg@MICCAI (2021)
Christian Marzahl, Christof A. Bertram, Frauke Wilm, Jörn Voigt, Ann K. Barton, Robert Klopfleisch, Katharina Breininger, Andreas Maier, Marc Aubreville
Learning to be EXACT, Cell Detection for Asthma on Partially Annotated Whole Slide Images. CoRR (2021)
Marc Aubreville, Christof A. Bertram, Taryn A. Donovan, Christian Marzahl, Andreas Maier, Robert Klopfleisch
Abstract: A Completely Annotated Whole Slide Image Dataset of Canine Breast Cancer to Aid Human Breast Cancer Research. Bildverarbeitung für die Medizin (2021)
Christian Marzahl, Marc Aubreville, Christof A. Bertram, Jason Stayt, Anne-Katherine Jasensky, Florian Bartenschlager, Marco Fragoso, Ann K. Barton, Svenja Elsemann, Samir Jabari, Jens Krauth, Prathmesh Madhu, Jörn Voigt, Jenny Hill, Robert Klopfleisch, Andreas Maier
Abstract: Deep Learning-based Quantification of Pulmonary Hemosiderophages in Cytology Slides. Bildverarbeitung für die Medizin (2021)
Frauke Wilm, Christof A. Bertram, Christian Marzahl, Alexander Bartel, Taryn A. Donovan, Charles-Antoine Assenmacher, Kathrin Becker, Mark Bennett, Sarah Corner, Brieuc Cossic, Daniela Denk, Martina Dettwiler, Beatriz Garcia Gonzalez, Corinne Gurtner, Annabelle Heier, Annika Lehmbecker, Sophie Merz, Stephanie Plog, Anja Schmidt, Franziska Sebastian, Rebecca C. Smedley, Marco Tecilla, Tuddow Thaiwong, Katharina Breininger, Matti Kiupel, Andreas Maier, Robert Klopfleisch, Marc Aubreville
Influence of Inter-Annotator Variability on Automatic Mitotic Figure Assessment. Bildverarbeitung für die Medizin (2021)
Christian Marzahl, Christof A. Bertram, Frauke Wilm, Jörn Voigt, Ann K. Barton, Robert Klopfleisch, Katharina Breininger, Andreas Maier, Marc Aubreville
Cell Detection for Asthma on Partially Annotated Whole Slide Images - Learning to be EXACT. Bildverarbeitung für die Medizin (2021)
Christian Marzahl, Christof A. Bertram, Marc Aubreville, Anne Petrick, Kristina Weiler, Agnes C. Gläsel, Marco Fragoso, Sophie Merz, Florian Bartenschlager, Judith Hoppe, Alina Langenhagen, Anne-Katherine Jasensky, Jörn Voigt, Robert Klopfleisch, Andreas Maier
Abstract: Are Fast Labeling Methods Reliable? - A Case Study of Computer-aided Expert Annotations on Microscopy Slides. Bildverarbeitung für die Medizin (2021)
Christian Marzahl, Frauke Wilm, Franz F. Dressler, Lars Tharun, Sven Perner, Christof A. Bertram, Christine Kröger, Jörn Voigt, Robert Klopfleisch, Andreas K. Maier, Marc Aubreville, Katharina Breininger
Robust Quad-Tree based Registration on Whole Slide Images. COMPAY@MICCAI (2021)
Christof A. Bertram, Taryn A. Donovan, Marco Tecilla, Florian Bartenschlager, Marco Fragoso, Frauke Wilm, Christian Marzahl, Katharina Breininger, Andreas Maier, Robert Klopfleisch, Marc Aubreville
Dataset on Bi- and Multi-nucleated Tumor Cells in Canine Cutaneous Mast Cell Tumors. Bildverarbeitung für die Medizin (2021)
Sonja Kunzmann, Christian Marzahl, Felix Denzinger, Christof A. Bertram, Robert Klopfleisch, Katharina Breininger, Vincent Christlein, Andreas K. Maier
First steps on Gamification of Lung Fluid Cells Annotations in the Flower Domain. CoRR (2021)
Christof A. Bertram, Taryn A. Donovan, Marco Tecilla, Florian Bartenschlager, Marco Fragoso, Frauke Wilm, Christian Marzahl, Katharina Breininger, Andreas Maier, Robert Klopfleisch, Marc Aubreville
Dataset on Bi- and Multi-Nucleated Tumor Cells in Canine Cutaneous Mast Cell Tumors. CoRR (2021)
Christof A. Bertram, Marc Aubreville, Christian Marzahl, Andreas K. Maier, Robert Klopfleisch
Abstract: How Big is Big Enough? Bildverarbeitung für die Medizin (2020)
Christian Marzahl, Christof A. Bertram, Marc Aubreville, Anne Petrick, Kristina Weiler, Agnes C. Gläsel, Marco Fragoso, Sophie Merz, Florian Bartenschlager, Judith Hoppe, Alina Langenhagen, Anne-Katherine Jasensky, Jörn Voigt, Robert Klopfleisch, Andreas K. Maier
Are fast labeling methods reliable? A case study of computer-aided expert annotations on microscopy slides. CoRR (2020)
Frauke Wilm, Christof A. Bertram, Christian Marzahl, Alexander Bartel, Taryn A. Donovan, Charles-Antoine Assenmacher, Kathrin Becker, Mark Bennett, Sarah Corner, Brieuc Cossic, Daniela Denk, Martina Dettwiler, Beatriz Garcia Gonzalez, Corinne Gurtner, Annika Lehmbecker, Sophie Merz, Stephanie Plog, Anja Schmidt, Rebecca C. Smedley, Marco Tecilla, Tuddow Thaiwong, Katharina Breininger, Matti Kiupel, Andreas Maier, Robert Klopfleisch, Marc Aubreville
How Many Annotators Do We Need? - A Study on the Influence of Inter-Observer Variability on the Reliability of Automatic Mitotic Figure Assessment. CoRR (2020)
Christian Marzahl, Marc Aubreville, Christof A. Bertram, Stefan Gerlach, Jennifer Maier, Jörn Voigt, Jenny Hill, Robert Klopfleisch, Andreas K. Maier
Is Crowd-Algorithm Collaboration an Advanced Alternative to Crowd-Sourcing on Cytology Slides? Bildverarbeitung für die Medizin (2020)
Marc Aubreville, Christof A. Bertram, Samir Jabari, Christian Marzahl, Robert Klopfleisch, Andreas K. Maier
Inter-Species, Inter-Tissue Domain Adaptation for Mitotic Figure Assessment. Bildverarbeitung für die Medizin (2020)
Christof A. Bertram, Mitko Veta, Christian Marzahl, Nikolas Stathonikos, Andreas K. Maier, Robert Klopfleisch, Marc Aubreville
Are pathologist-defined labels reproducible? Comparison of the TUPAC16 mitotic figure dataset with an alternative set of labels. CoRR (2020)
Christian Marzahl, Christof A. Bertram, Marc Aubreville, Anne Petrick, Kristina Weiler, Agnes C. Gläsel, Marco Fragoso, Sophie Merz, Florian Bartenschlager, Judith Hoppe, Alina Langenhagen, Anne-Katherine Jasensky, Jörn Voigt, Robert Klopfleisch, Andreas Maier
Are Fast Labeling Methods Reliable? A Case Study of Computer-Aided Expert Annotations on Microscopy Slides. MICCAI (1) (2020)
Marc Aubreville, Christof A. Bertram, Taryn A. Donovan, Christian Marzahl, Andreas Maier, Robert Klopfleisch
Dogs as Model for Human Breast Cancer: A Completely Annotated Whole Slide Image Dataset. CoRR (2020)
Christof A. Bertram, Mitko Veta, Christian Marzahl, Nikolas Stathonikos, Andreas K. Maier, Robert Klopfleisch, Marc Aubreville
Are Pathologist-Defined Labels Reproducible? Comparison of the TUPAC16 Mitotic Figure Dataset with an Alternative Set of Labels. iMIMIC/MIL3ID/LABELS@MICCAI (2020)
Christian Marzahl, Marc Aubreville, Christof A. Bertram, Jennifer Maier, Christian Bergler, Christine Kröger, Jörn Voigt, Robert Klopfleisch, Andreas K. Maier
EXACT: A collaboration toolset for algorithm-aided annotation of almost everything. CoRR (2020)
Christian Marzahl, Marc Aubreville, Christof A. Bertram, Stefan Gerlach, Jennifer Maier, Jörn Voigt, Jenny Hill, Robert Klopfleisch, Andreas K. Maier
Fooling the Crowd with Deep Learning-based Methods. CoRR (2019)
Jens Krauth, Stefan Gerlach, Christian Marzahl, Jörn Voigt, Heinz Handels
Synthetic Training with Generative Adversarial Networks for Segmentation of Microscopies. Bildverarbeitung für die Medizin (2019)
Christian Marzahl, Marc Aubreville, Christof A. Bertram, Jason Stayt, Anne-Katherine Jasensky, Florian Bartenschlager, Marco Fragoso-Garcia, Ann K. Barton, Svenja Elsemann, Samir Jabari, Jens Krauth, Prathmesh Madhu, Jörn Voigt, Jenny Hill, Robert Klopfleisch, Andreas K. Maier
Deep Learning-Based Quantification of Pulmonary Hemosiderophages in Cytology Slides. CoRR (2019)
Marc Aubreville, Christof A. Bertram, Christian Marzahl, Corinne Gurtner, Martina Dettwiler, Anja Schmidt, Florian Bartenschlager, Sophie Merz, Marco Fragoso, Olivia Kershaw, Robert Klopfleisch, Andreas Maier
Field of Interest Prediction for Computer-Aided Mitotic Count. CoRR (2019)
Marc Aubreville, Christof A. Bertram, Samir Jabari, Christian Marzahl, Robert Klopfleisch, Andreas K. Maier
Learning New Tricks from Old Dogs - Inter-Species, Inter-Tissue Domain Adaptation for Mitotic Figure Assessment. CoRR (2019)
Henriette Rau, Jacob Grieger, Christian Marzahl, Peter Penndorf, Martin Staemmler
Unobtrusive Fall Detection and Prevention: Extending From a Prototype Test to a Pilot Trial. GI-Jahrestagung (2012)